Instalações

Temos recursos para análise de hidrocarbonetos leves (CH4, C2H2, C2H4, etc.) por cromatografia gasosa, análise fluorométrica de clorofila e amônio (Turner Trilogy) e comprimento de onda fixo e espectroscopia UV-vis de varredura (Shimadzu).

Equipado para manutenção de cultura de plâncton (incubadoras com controle de luz e temperatura, microscópios), genética de populações moleculares (termocicladores, sonicador, fluorômetro Qubit, espectrofotômetro UV/Vis, banhos-maria, sistema de documentação de gel) e análises genômicas (servidor Linux, CLC Genomics bancada).

Câmara ambiental controlada (4-40 C, umidade controlada), microscópio de epifluorescência Olympus (lâmpada Xenon de 150 W, cubos de fluorescência UV a IR), Stratagene Real Time PCR, 2 BioRad PCR cicladores, sistemas de eletroforese BioRad incluindo gel de campo pulsado com banho resfriador, estação de documentação de gel, reticulador UV, forno de hibridização, capa de biossegurança tipo II, Speedvac, 4 freezers ultracold -80C, 3 incubadoras de agitação, lava-louças Miele, 4 coletores de filtração de 10 posições, 8 bombas de vácuo/pressão, bombas peristálticas Masterflex , garrafas de amostragem oceanográfica, reformadas (2012) Profiling Natural Fluorometer, vasos de filtração de pressão (2×20 e 40 litros), porta-filtros de aço inoxidável 6×142 mm, 2 porta-filtros de teflon 142 mm, centrífugas refrigeradas de alta velocidade (2 unidades de piso e 2 bancadas, cada uma com vários rotores), 3 banhos circulantes refrigerados/aquecidos, faca de diamante para preparações de seção fina TEM. Temos 2 servidores informáticos dedicados (nosso laboratório) para bioinformática (por exemplo, montagem metagenômica), com 1 TB de RAM e 120 processadores, adquiridos em 2014 e 2020.

Laboratório. O laboratório do Dr. Thrash (1.500 pés quadrados) está localizado no prédio da Allan Hancock Foundation na University of Southern California. O laboratório está equipado para coleta e transporte de água em grande escala com garrafões de policarbonato de 1-20 L, equipamento de filtração (bomba peristáltica Cole-Parmer Masterflex I/P; conjuntos de filtros de 142 mm, 55 mm, 47 mm e 25 mm; Millipore Pellicon montagem de filtração de fluxo tangencial; tubulação), um freezer -20˚C e -80˚C, uma geladeira, 6 incubadoras secas, incubadoras frias portáteis, instalações completas de biologia molecular para extração de ácido nucléico e PCR (batedor de esferas, vórtices, banhos secos , banhos-maria, termocicladores e BioRad GelDoc EZ Imager, bandejas de gel e fontes de alimentação, fluorômetro Life Technologies Qubit, microcentrífugas refrigeradas e não refrigeradas Eppendorf e centrífuga de balde suspenso de bancada), estação de trabalho de fluxo laminar portátil AirClean de 24", incubadoras frias portáteis, um optode PreSens sistema, bomba de vácuo, exaustor, sistema de purificação de água Millipore Milli-Q, um conjunto completo de estoques químicos, balanças e um medidor de pH.

Infraestrutura de Cultivo. O Thrash Lab tem uma sala de cultivo dedicada contendo um citômetro de fluxo de bancada Millipore Guava EasyCyte 5HT HPL para contagem de células usando um laser de 488 nm (que é capaz de ser transportado e implantado a bordo), um citômetro de fluxo BD Accuri C6 Plus com lasers de 488 nm e 640 nm e um amostrador automático, um gabinete de biossegurança classe II/A para inoculação de mídia livre de contenção e manipulação de cultura, um robô de manipulação de fluidos Eppendorf epMotion 5075 com câmara filtrada por HEPA e um classificador de células ativado por fluorescência BD Influx com 355 nm, 488 nm e 640 nm lasers. Em outra parte do laboratório estão dois dewars de nitrogênio líquido ThermoScientific Locator 6 Plus para armazenamento de coleta de cultura e uma bancada dedicada e sistema de armazenamento de tanque para cultivo anaeróbico. Também temos uma câmara anaeróbica COY Classe A e um porta-luvas microaerófilo. Temos um conjunto completo de recipientes de cultivo, incluindo frascos de soro, 50 placas personalizadas de PTFE de 96 x 2,1 mL e frascos de policarbonato e PTFE de tamanhos variados. Por fim, o laboratório possui um banho de ácido para cultivo limpo de metais-traço.

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Há uma série de instalações no AltaSea, incluindo:

Como Fazemos a Diferença